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Seminari laurendi di Biotecnologie.
Si rende noto che, nell'ambito delle imminenti lauree triennali in Biotecnologie, il prossimo martedì 21 ottobre a partire dalle ore 15:00, presso la Sala Riunioni del Dipartimento di Matematica e Informatica, avranno luogo i seminari.
| Cosa | |
|---|---|
| Quando |
21/10/2008 16:15
21/10/2008 17:45
21/10/2008 da 16:15 al 17:45 |
| Dove | Sala Riunioni |
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ore 16:15
Laureanda: Margherita Bodini
Titolo: Analisi filogenetica per la ricerca di elementi di regolazione nel gene NPM1
Sommario: la tesi sulla quale si basa il seminario tratta di un'analisi svolta sul gene NPM1, noto per essere rilevante nella leucemia mieloide acuta in pazienti con cariotipo normale. Per tale analisi sono state prese in esame, attraverso allineamenti multipli con le omologhe di altre quattro specie, la sequenza proteica di nucleofosmina e la sequenza nucleotidica comprendente il trascritto primario e le 40 Kb adiacenti a monte e a valle. Nel seminario verranno presentati, oltre ai risultati, i metodi utilizzati e cioè i programmi di allineamento (MSA, ClustalX, Tcoffee, MLAGAN), le procedure di validazione statistica e due programmi per la ricerca di fattori di trascrizione. Inoltre, verrà proposta una pipeline per la ricerca di elementi di regolazione all'interno di sequenze non codificanti adiacenti al trascritto genico.
ore 15:45
Laureando: Yari Ciani
Titolo: Notazioni grafiche per la rappresentazione di network biologici
Sommario: saranno descritte le principali tipologie di notazioni grafiche per la rappresentazione di network biologici. In particolare, sarà approfondita la descrizione di MIM (Molecular Interaction Map) e di PD (Process Diagram). Quest'ultima notazione è uno dei tre linguaggi (per ora l'unico ufficialmente specificato) previsti da SBGN (Systems Biology Graphical Notation). SBGN è candidato a diventare il linguaggio standard per la rappresentazione grafica di network biologici. Infine, sarà presentato un modello grafico in notazione PD della fosforilazione ossidativa mitocondriale.
Tutti gli interessati sono cordialmente invitati a partecipare.
Nicola Vitacolonna
